É composta por cinco (5) Circunscrições Hidrográficas:

• região dos rios Jequitaí, Pacuí e trecho do rio São Francisco, de jusante da confluência com o rio Abaeté até jusante da confluência com o rio Urucuia (exceto os rios Urucuia e Paracatu) - SF6;

• bacia do rio Paracatu - SF7;

• bacia do rio Urucuia e afluentes da margem esquerda do rio São Francisco entre os rios Paracatu e Urucuia - SF8;

• rio São Francisco, de jusante da confluência com o rio Urucuia até montante da confluência com o rio Carinhanha - SF9;

• bacia do rio Verde Grande - SF10.